预后与患者的年龄、病情、有无并发症、毒血症程度、病菌的毒力、治疗及时否、治疗方法、是否接受预防注射以及病原菌的毒力等有关。一般情况下副伤寒的预后良好，恢复后慢性带菌者较少见。
老年人以及婴幼儿的抵抗能力差，因此预后情况会相对较差，可能无法彻底治愈；明显贫血，营养不良者体质和免疫力较差，因此预后情况也较差；病情严重兼并有并发症肠穿孔、肠出血、心肌炎、严重毒血症等患者预后情况不良，病死率相对较高。丙型副伤寒引起骨髓炎、体腔或组织脓肿较多，应加以注意。